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La sélection variétale assistée par marqueurs

A8404

Présentation

Objectifs

 

Comprendre le principe du marquage moléculaire, les différentes technologies utilisables et leurs applications dans les principaux schémas de sélection variétale.

Travaux pratiques sur machines : cartographie et sélection assistée par marqueurs

Public(s) concerné(s)

Sélectionneurs et personnel de terrain, ingénieurs et techniciens de laboratoire


PRÉREQUIS : › Avoir des connaissances en génétique

Programme

PREMIERE JOURNEE DE MISE A NIVEAU, PROGRAMME 1 OU 2 AU CHOIX

Programme 1 : destiné aux sélectionneurs

Objectifs : Connaître les principes de la biologie moléculaire

-        ADN et structure des génomes

-        Expression des gènes, régulation

-        Principes de l’hybridation moléculaire

-        La technique de PCR : réaction en chaîne de polymérisation

-        Principaux types d’électrophorèse d’ADN

-        Les enzymes de restriction et autres enzymes auxiliaires

-        Clonage et séquençage de fragments d'ADN

Programme 2 destiné aux ingénieurs et techniciens de laboratoire

Objectifs : Comprendre les notions de génétique indispensables pour la sélection végétale.

-        Rappels de génétique formelle

-        Notions de génétique quantitative : caractères polygéniques, héritabilité, QTL* (locus contrôlant la variation des caractères quantitatifs)

-        Notions de génétique des populations : fréquences alléliques, forces évolutives, déséquilibre de liaison

-        Modes d’obtention de lignées et d’hybrides

-        Principe de détection des QTL,* 

PROGRAMME COMMUN AUX TROIS JOURS SUIVANTS :

Les différentes techniques de marquage moléculaire

-        Notions de base sur le polymorphisme moléculaire

-        Principes techniques pour cibler un locus et révéler du polymorphisme

-        Génotypage SNP*

-        Séquençage « nouvelle génération »

Utilisation des marqueurs moléculaires pour gérer et valoriser des ressources génétiques

-        Description et évaluation de la diversité au niveau moléculaire

-        Structuration de la diversité dans les collections

-        Marqueurs, phylogénie et phylogéographie

-        Méthodologies de gestion de la diversité dans les collections

-        Valorisation de la biodiversité

Cartographie génétique  

-        Principe et méthodes de la cartographie génétique

-        Différentes populations de cartographie

-        TD / Démonstration : construction de cartes génétiques

Cartographie et caractérisation de locus contrôlant la variation des caractères quantitatifs (QTL) : principes et quelques exemples

Sélection assistée par marqueurs pour des gènes majeurs et des QTL : principes et quelques exemples

Sélection génomique : principes et quelques exemples

Introduction à la génétique d’association : principe et quelques exemples

Approches de génomique pour l’amélioration des plantes

-        Approche gène candidat

-        Recherche de colocalisations gène-QTL*

-        Etude du transcriptome et du protéome

-        Carte génétique et carte physique, clonage positionnel, séquençage génomique

TRAVAUX PRATIQUES

-      Estimation des distances génétiques à partir de données de ségrégation

-      Construction de cartes génétiques

-      Détection de QTL*

-      Utilisation des QTL* en sélection et Utilisation d’OptiMAS

 

* QTL : Quantitative Trait Locus

* SNP : Single Nucleotide PolymorphismRECHERCHE

Méthode pédagogique

Apports théoriques, exposés, analyses, discussions, travaux pratiques

 

ÉVALUATION ET SUIVI :

› Questions-réponses, exercices d’application, questionnaire de satisfaction, attestation de formation

Photos / Vidéos

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Vidéos

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Testez vos connaissances

Du 27/03/18 au 30/03/18

Durée : 4 jour(s)

Lieu : Gif sur Yvette (91)

Prix : 1 800 € HT

Déjeuner compris


Responsable de la formation :

Marie RIANT

01 42 33 77 79

marie.riant@gnis.fr

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